MIABIS (Minimum Information About BIobank data Sharing)
ein weit verbreitetes Standardmodell für Biobanken, das insbesondere für Software wie BioARCHIVE und deren Interoperabilität mit anderen Systemen relevant ist.
Durch Integration von MIABIS in BioARCHIVE kannst du:
- Probenkollektionen standardisiert beschreiben
- Interoperabilität mit anderen Biobanken (z. B. TMF, BBMRI) ermöglichen
- Exporte für Forschungsprojekte / Kooperationspartner liefern
- Kompatibilität mit EU-weiten Biobankverzeichnissen schaffen
🔷 Was ist MIABIS?
MIABIS steht für:
Minimum Information About BIobank data Sharing
Es handelt sich um einen Datenstandard, der von BBMRI-ERIC (Biobanking and BioMolecular Resources Research Infrastructure – European Research Infrastructure Consortium) entwickelt wurde, um Metadaten von Biobanken und Proben einheitlich zu beschreiben. Ziel ist die Vereinheitlichung, Austauschbarkeit und Wiederverwendbarkeit von Biobankdaten innerhalb Europas und international.
Hauptziele von MIABIS
- Standardisierung der Informationen über Biobanken, Proben und Spenderdaten
- Erleichterung der Suche und des Austauschs von Probenmaterial
- Interoperabilität zwischen verschiedenen Systemen und Ländern
- Unterstützung von FAIR-Prinzipien: Findable, Accessible, Interoperable, Reusable
MIABIS Komponenten (Module)
MIABIS besteht aus mehreren Modulen, die strukturierte Informationen zu folgenden Bereichen liefern:
1. Biobank-Modul
- Name der Biobank
- Institution
- Standort
- Kontakt
- Rechtsstatus (öffentlich/privat)
- Zugangsvoraussetzungen
2. Collection-Modul (Probenkollektionen)
- Probenart (z. B. Blut, Gewebe, DNA)
- Sammlungsmethode
- Verarbeitung & Lagerung
- Krankheitsbezug
- Zugriffsrestriktionen
3. Sample-Modul (Einzelprobe) – optional, bei fein granularer Erfassung
- Aliquot-Informationen
- Lagerbedingungen
- Barcode / ID
- Materialtyp
4. Donor-Modul
- Alter, Geschlecht
- Gesundheitszustand
- ethnische Herkunft (optional, datenschutzkonform)
- Einwilligung (Typ, Umfang, Gültigkeit)
Technisches Datenmodell
MIABIS ist formal in JSON oder OWL (Web Ontology Language) beschrieben und folgt einem relationalen Modell, das sich leicht in bestehende LIMS- oder Biobank-Software integrieren lässt.
- Beispiel-Datenmodell:
https://github.com/BBMRI-ERIC/miabis/blob/master/schema/json/miabis-collection-schema.json - Ontologie-Version via BioPortal:
https://bioportal.bioontology.org/ontologies/MIABIS
Offizielle Quellen
- BBMRI-ERIC MIABIS Hub:
https://github.com/BBMRI-ERIC/miabis
(Enthält technische Dokumentation und Beispielstrukturen) - Publikation zum Standard:
MIABIS 2.0 — A guideline for biobank metadata standardization - Integration in BBMRI Directory:
https://directory.bbmri-eric.eu
(Hier werden Biobanken basierend auf MIABIS beschrieben)